Прошло три десятилетия после того, как Третья мировая и ядерные удары стерли с лица земли столицу Японии. На её пепелище вырос Нью-Токио. Город сияет неоном, но это лишь фасад. Реальность — жёсткий полицейский режим, похожий на старые фашистские диктатуры. Любое инакомыслие, любой намёк на бунт давится мгновенно и безжалостно.
В секретных лабораториях, скрытых от глаз, идёт другая война. Учёные, подчинённые военным, ставят опыты над людьми. Их цель — раскрыть силу разума, создать из человеческой психики абсолютное оружие. Во главе этого мрачного проекта стоит полковник Сикисима. Его амбиции и методы всё чаще приводят к столкновениям с официальными властями, сея раздор в верхах.
А внизу, среди обычных людей, зреет иная сила. Расползаются слухи, рождается странная вера. Культ, поклоняющийся некому Акире. Говорят, это сверхсущество, почти бог. Его приход, шепчут в темноте, станет спасением, избавит Японию от всех бед. Город живёт в ожидании, разрываясь между железной хваткой власти, тайнами лабораторий и призрачной надеждой на чудо.